新皇崗口岸即將投入服務。為配合口岸啟用後新增的跨境客運需求，運輸署公布四條新專營巴士路線的營運安排，並由九巴、城巴、新大嶼山巴士，三間專營巴士公司分別負責營運，以加強新界東北及新界西北地區與新口岸的公共交通接駁。新大嶼山巴士亦首次擴展服務範圍至新界東。
新皇崗口岸將實施「合作查驗，一次放行」的全新模式，保安局局長鄧炳強指，市民於新口岸過關時只需出示一次目的地證件，即可一併完成兩地的出入境手續，毋須再如以往般多次上落轉乘過境「皇巴」，通關時間預計可由原來的半小時大幅縮短至5分鐘。他又指，新口岸預計落成初期每日可處理約 20 萬人次旅客，未來配合港鐵北環線支線發展，相信可提升至 30 萬人次。
現有「皇巴士」多年來肩負連接新界北區居民與深圳的跨境交通角色，尤其在皇崗口岸 24 小時通關期間，為跨境上班族、學生及夜間往返旅客提供穩定服務。隨着新皇崗口岸落成，原有皇巴士服務逐步完成歷史任務，車隊亦將按運輸署既定程序進行「服務轉型」。
現時由「中港直通巴士」、「跨境全日通」，及「跨境快線」營運的五條來往市區的跨境巴士服務將在新皇崗口岸繼續，包括「旺角線」、「油尖線」、「觀塘線」、「灣仔線」及「荃灣線」。運輸署正與營辦商研究優化及加強服務，包括調整行車路線及服務範圍。
四條新專營巴士路線
- 九巴營運：皇崗口岸 ↔ 葵翠邨公共運輸交匯處
途經葵芳、青衣及大欖隧道轉車站，服務葵青區及新界西北跨境乘客。 - 嶼巴營運：皇崗口岸 ↔ 烏溪沙站公共運輸交匯處
途經馬鞍山、科學園、廣福邨轉車站、古洞北新發展區及新田公共運輸交匯處，為新界東及北部都會區提供跨境接駁服務。 - 城巴營運：皇崗口岸 ↔ 青山灣巴士總站
途經屯門市中心及洪水橋。該路線於星期六、日及公眾假期提供全日服務，以配合區內休閒及跨境出行需求。 - 城巴營運：皇崗口岸 ↔ 啟德世運道（經中九龍幹線）
途經啟德及大欖隧道轉車站。服務初期於每日早、晚繁忙時段提供班次；如啟德區舉行大型活動，服務時間可延長至凌晨，並按活動完結時間調整尾車安排。
運輸署正與三間專營巴士公司跟進四條新路線的營運細節，稍後公布投入服務日期、服務時間及班次等詳情，以配合新皇崗口岸的啟用。
新田公共運輸交匯處過渡安排
新皇崗口岸啟用初期，新田公共運輸交匯處將維持運作。現時可接駁「皇巴士」的兩條專營巴士線（976A、N73）及六條專線小巴線（44B、44B1、78、N44B、79S、616S）之終點站將延伸至新口岸；另專營巴士線 276B 亦會提供特別班次往返新口岸，以加強北區及新界西北的跨境交通連接。
皇巴士安排
全名為「落馬洲－皇崗過境穿梭巴士」的皇巴士於 1997 年 3 月 20 日正式投入服務，提供往返香港落馬洲與深圳皇崗口岸的跨境接駁巴士服務。根據港深兩地政府的協議，雙方須各自選定一間營辦商，共同組成聯營公司負責營運穿梭巴士服務。
香港方面的營辦商以公開招標方式選出，由九巴控股投得營運權；深圳市政府則委任新福港運輸發展有限公司為內地營辦商，該公司由新田鄉紳文伙泰等人持有。皇巴士的日常營運管理則由九巴母公司「載通國際」旗下的「新香港巴士」（由陽光巴士管理）負責。
運輸署指，已與皇巴士營辦商完成溝通，並會按既定程序處理皇巴士車隊於服務終止後的「服務轉型」申請。
